Nicolau de Flue nasceu em 1417, era o filho mais velho de ricos agricultores. Sua vida seguia os padrões da época: entrou no exército aos 21 anos, tendo tomado parte em algumas batalhas; excelente soldado, ao longo do tempo foi promovido a oficial, tendo alcançado o posto de capitão. Quando tinha cerca de 30 anos casou com Dorothy Wiss, com quem teve cinco meninos e cinco meninas. Em 1459 foi eleito juiz do cantão (estado) onde residia, tendo servido no posto por nove anos.
A vida de oração já o atraia bastante mas as ocupações do mundo tomavam seu tempo. Certa vez teve uma visão mística de um lírio que crescia de sua boca e subia aos céus mas que acabou sendo comido por um cavalo. Ele compreendeu representar que as tarefas cotidianas estavam a engolir sua vida espiritual (lírios são associados à pureza). Aos 50 anos, com o consentimento da esposa e filhos, decidiu tornar-se um eremita e dedicar todo seu tempo à oração.
Segundo registros históricos teria jejuado por 19 anos alimentando-se apenas da Eucaristia. Sua visões continuaram no centro de sua experiência, mas logo adquiriu fama por sua sabedoria ao aconselhar aqueles que lhe procuravam, levando à pessoas de toda Europa a peregrinarem até sua ermida em busca de sua palavras. Neste papel evitou uma guerra civil na Suiça quando o antagonismo entre as diferentes regiões aumentou até o quase confronto. Cartas enviados pelas diferentes governos ainda existem comprovando sua influência na união do país, o mais estável na Europa Central até hoje.
